抗涝性植物最明显的生理特征是通过发达的通气组织将地上部分吸收的O2输送到根部或其他缺氧部位。以水稻和小麦为例,水稻幼根的皮层为柱状排列,而小麦为偏斜排列。前者的胞间空隙比后者大得多。成长之后,小麦根结构上没有变化,水稻根皮层内细胞大多数崩溃,形成特殊的通气组织。通过这种组织把O2顺利地运输到根部。某些植物(如甜茅属)在淹水时改变呼吸途径,开始缺O2刺激糖酵解途径,但以后磷酸戊糖途径占优势,减少有毒物质的形成;水稻根内乙醇氧化酶活性很高以减少乙醇的积累;提高有氧呼吸的能力,玉米根缺O2通过细胞色素C的活性提高来维持线粒体膜上的电子传递。