土壤中的细菌占土壤微生物总数量的70%~90%,它们是已知生物中结构最简单、个体最小的类群之一,属原核单细胞生物,细菌个体虽小,但种类多、繁殖快、数量大。细菌个体的基本外形为球形,杆状和分枝状(图64)。土壤中的大部分细菌都是腐生细菌,即依赖分解有机物质获得营养和能量,如氨化细菌、纤维分解细菌、反硝化细菌、磷细菌和钾细菌等。有些细菌依靠氧化无机化合物取得能量,这些细菌称为化能自养细菌,如硫细菌、硝化细菌、铁细菌。有些细菌能与植物共生称为共生细菌,如共生固氮菌、内生菌根真菌、外生菌根真菌。有些细菌如蓝细菌,会有色素,能吸收光能,称为光能自养细菌。